באופן כללי, כן. מחקרים הראו שלנשים חולות קוליטיס כיבית יש את אותה רמת פוריות כמו נשים ללא מחלת מעי דלקתית. המחקרים של רמת הפוריות של נשים חולות במחלת קרוהן חלוקים בתוצאותיהם. מחקר גדול אחד לא מצא הבדל בשיעורי הפריון, אולם מחקרים ישנים יותר וכאלו שבוצעו לאחרונה הראו שיעור הריונות נמוך במקצת. דבר זה נכון לגבי מחלת קרוהן פעילה, ולא לגבי מחלה שקטה, בה שיעורי ההריונות זהים לאלו של האוכלוסייה הכללית.
אם בן הזוג מטופל בסולפה-סאלאזין, עלול להיווצר אי-פריון זמני מכיוון שתרופה זו מפחיתה את ייצור תאי הזרע, באופן הפיך. לפני שמנסים להרות, על הגבר להפסיק את הטיפול בסולפה-סאלאזין ו/או לעבור לטיפול בתכשירי 5-ASA כגון אסאקול, דיפנטום, פנטאזה, או רפאסל, שלא הראו פגיעה בייצור תאי הזרע.