עם בוא החורף מומלץ לכל החולים עם קרוהן וקוליטיס כיבית להתחסן כנגד שפעת. זאת, לאור הסיכון ששפעת עלולה לגרור התקף במחלת המעי מחד ואפשרות לשפעת קשה יותר מאידך, בנוכחות מחלה כרונית בסיסית. 

יש לציין שאנשים שמקבלים תרופות נוגדות חיסון למחלת המעי הדלקתית (כגון אימורן, פורינתול, מתוטרקסאט וכל התרופות הביולוגיות) רשאים להתחסן רק בחיסון מומת (כלומר החיסון שמגיע בזריקה) ולא בחיסון החי-מוחלש שמגיע כתרסיס לאף (הרבה פחות נפוץ מהחיסון בזריקה שהוא הסטנדרטי כיום). 

ואם כבר מדברים על חיסונים מומלץ לחולי מחלות מעי דלקתיות לוודא עם רופא הילדים או המשפחה שהסטטוס החיסוני הכללי מעודכן. במיוחד יש לוודא חיסון לדלקת ריאות (פנאומקוק) כולל תוספת שלא נמצאת בשגרה. כדאי לשאול את הרופאים המטפלים על כך. 

עוד על חיסונים באתר המרכז לקרוהן וקוליטיס בילדים של שערי צדק:  

https://www.szmc.org.il/heb/Departments/Peds-IBD-Center/Information/Vaccinations-And-IBD/